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Dernière mise à jour : Mai 2021

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Unité de Nutrition Humaine

Zone de texte éditable et éditée et rééditée

Publications

Liste des publications issues de l'équipe PFEM

mots-clef-publications

Contribution des °Doctorants et Post-doctorants.
(D: développement de méthodes, C: projets collaboratif, S: composante scientifique)

2020

Retrouvez toutes les publications de la PFEM sur son instance HAL dédiée.

2021

Zanin M, Aitya N. A. A., Basilio J, Baumbach J, Benis A, Behera C. K., Bucholc M, Castiglione F, Chouvarda I, Comte B, Dao T-T, Ding X, Pujos-Guillot E, Filipovic N, Finn D. P., Glass D. H., Harel N., Iesmantas T, Ivanoska I, Joshi A, Zouaoui Boudjeltia K, Kaoui B, Kaur D, Maguire L. P., McClean P. L., McCombe N, de Miranda J L, Moisescu M A, Pappalardo F, Polster A, Prasad G, Rozman D, Sacala I, Sanchez-Bornot J. M., Schmid J. A., Sharp T, Solé-Casals J, Spiwok V, Spyrou G. M., Stalidzans E, Stres B, Sustersic T, Symeonidis I, Tieri P, Todd S, Van Steen K, Veneva M, Wang D-H, Wang H, Wang H, Watterson S, Wong-Lin KF, Yang S, Zou X, Schmidt H. H. H. W. An Early Stage Researcher’s Primer on Systems Medicine Terminology. Network and Systems Med. In press

Tavella T, Rampelli S, Guidarelli G, Battista G, Bazzocchi A, Mercatelli D, Pujos-Guillot E, Comte B, Barone M, Biagi E, Candela M, Nicoletti C, Kadi F, O’Toole P, Franceschi C, Brigidi P, Turroni S, Santoro A. Elevated gut microbiome abundance of Christensenellaceae, Porphyromonadaceae, Rikenellaceae and Bacteroidaceae is associated with reduced visceral adipose tissue and healthier metabolic profile in Italian elderly. Gut Microbes.

2020

Production scientifique métabolomique | INRAE

Robin Pla, Estelle Pujos-Guillot, Stéphanie Durand, Marion Brandolini-Bunlon, Delphine Centeno, David B Pyne, Jean-François Toussaint, Philippe Hellard. Non-targeted metabolomics analyses by mass spectrometry to explore metabolic stress after six training weeks in high level swimmers. J Sports Sci. 2020 Dec 15;1-10.

Keller, J.; Chevolleau, S.; Noguer-Meireles, M.-H.; Pujos-Guillot, E.; Delosière, M.; Chantelauze, C.; Joly, C.; Blas-y-Estrada, F.; Jouanin, I.; Durand, D.; Pierre, F.; Debrauwer, L.; Theodorou, V.; Guéraud, F. Heme-Iron-Induced Production of 4-Hydroxynonenal in Intestinal Lumen May Have Extra-Intestinal Consequences through Protein-Adduct Formation. Antioxidants 2020, 9, 1293.

Mainka M, Dalle C, Pétéra M, Dalloux-Chioccioli J, Kampschulte N, Ostermann AI, Rothe M, Bertrand-Michel J, Newman JW, Gladine C, Schebb NH. Harmonized procedures lead to comparable quantification of total oxylipins across laboratories. J Lipid Res. 2020 Nov;61(11):1424-1436. doi: 10.1194/jlr.RA120000991. 

Insaf Berrazaga, Jérôme Salles, Karima Laleg, Christelle Guillet, Véronique Patrac, Christophe Giraudet, Olivier Le Bacquer, Marine Gueugneau, Philippe Denis, Corinne Pouyet, Angelique Pion, Phelipe Sanchez, Yves Boirie, Valérie Micard, Stéphane Walrand. Anabolic Properties of Mixed Wheat-Legume Pasta Products in Old Rats: Impact on Whole-Body Protein Retention and Skeletal Muscle Protein Synthesis. Nutrients. 2020 May 29;12(6):1596. 

Lucie Lécuyer, Céline Dalle, Sophie Lefevre-Arbogast, Pierre Micheau, Bernard Lyan, Adrien Rossary, Aicha Demidem, Mélanie Petera, Marie Lagree, Delphine Centeno, Pilar Galan, Serge Hercberg, Cecilia Samieri, Nada Assi, Pietro Ferrari, Vivian Viallon, Mélanie Deschasaux, Valentin Partula, Bernard Srour, Paule Latino-Martel, Emmanuelle Kesse-Guyot, Nathalie Druesne-Pecollo, Marie-Paule Vasson, Stéphanie Durand, Estelle Pujos-Guillot, Claudine Manach and Mathilde Touvier. Diet-Related Metabolomic Signature of Long-Term Breast Cancer Risk Using Penalized Regression: An Exploratory Study in the SU.VI.MAX Cohort. Cancer Epidemiol Biomarkers Prev 2020;29:396–405

Monnerie S, Comte B, Ziegler D, Morais JA, Pujos-Guillot E, Gaudreau P. Metabolomic and Lipidomic Signatures of Metabolic Syndrome and its Physiological Components in Adults: A Systematic Review. Sci Rep. 2020 Jan 20;10(1):669. https://dx.doi: 10.1038/s41598-019-56909-7

Comte B, Baumbach J, Benis A, Basílio J, Debeljak N, Flobak Å, Franken C, Harel N, He F, Kuiper M, Méndez Pérez J-A, Pujos-Guillot E, Režen T, Rozman D, Schmid J.A., Scerri J, Tieri P, Van Steen K, Vasudevan S, Watterson S, and Schmidt H.H.H.W.. Network and Systems Medicine: Position Paper of the European Collaboration on Science and Technology Action on Open Multiscale Systems Medicine. Network and Systems Med, 2020 Jul. https://dx.doi.org/10.1089/nsm.2020.0004, https://hal.inrae.fr/hal-02957776

Ghosh TS, Rampelli S, Jeffery IB, Santoro A, Neto M, Capri M, Giampieri E, Jennings A, Candela M, Turroni S, Zoetendal EG, Hermes GDA, Elodie C, Meunier N, Brugere CM, Pujos-Guillot E, Berendsen AM, De Groot LCPGM, Feskins EJM, Kaluza J, Pietruszka B, Bielak MJ, Comte B, Maijo-Ferre M, Nicoletti C, De Vos WM, Fairweather-Tait S, Cassidy A, Brigidi P, Franceschi C, O'Toole PW. Mediterranean diet intervention alters the gut microbiome in older people reducing frailty and improving health status: the NU-AGE 1-year dietary intervention across five European countries. Gut. 2020 Jul;69(7):1218-1228. https://dx.doi: 10.1136/gutjnl-2019-319654. Epub 2020 Feb 17.

Wang H, Pujos-Guillot E, Comte B, de Miranda J-L, Spiwok V, Chorbev I, Castiglione F, Tieri P, Watterson S, McAllister R, de Melo Malaquias T, Zanin M, Singh Rai T, Zheng H. Deep Learning in Systems Medicine: White Paper by the COST Action CA15120 Open Multiscale Systems Medicine. Briefing in Bioinformatics. 2020, baa237. https://dx.doi: doi.org/10.1093/bib/bbaa237

Yanibada B, Hohenester U, Pétéra M, Canlet C, Durand S, Jourdan F, Boccard J, Martin C, Eugène M, Morgavi DP, Boudra H. Inhibition of enteric methanogenesis in dairy cows induces changes in plasma metabolome highlighting metabolic shifts and potential markers of emission. Sci Rep. 2020 Sep 24;10(1):15591. doi: 10.1038/s41598-020-72145-w.

Lécuyer L, Dalle C, Micheau P, Pétéra M, Centeno D, Lyan B, Lagree M, Galan P, Hercberg S, Rossary A, Demidem A, Vasson MP, Partula V, Deschasaux M, Srour B, Latino-Martel P, Druesne-Pecollo N, Kesse-Guyot E, Durand S, Pujos-Guillot E, Manach C, Touvier M. Untargeted plasma metabolomic profiles associated with overall diet in women from the SU.VI.MAX cohort. Eur J Nutr. 2020 Dec;59(8):3425-3439. doi: 10.1007/s00394-020-02177-5.

Poupin N, Vinson F, Moreau A, Batut A, Chazalviel M, Colsch B, Fouillen L, Guez S, Khoury S, Dalloux-Chioccioli J, Tournadre A, Le Faouder P, Pouyet C, Van Delft P, Viars F, Bertrand-Michel J, Jourdan F. Improving lipid mapping in Genome Scale Metabolic Networks using ontologies. Metabolomics. 2020 Mar 25;16(4):44. doi: 10.1007/s11306-020-01663-5. - D

Production scientifique métabolomique | UCA

Jousse C, Dalle C, Abila A, Traikia M, Diogon M, Lyan B, El Alaoui H, Vidau C, Delbac F. A combined LC-MS and NMR approach to reveal metabolic changes in the hemolymph of honeybees infected by the gut parasite Nosema ceranae. J Invertebr Pathol. 2020 Oct;176:107478. doi: 10.1016/j.jip.2020.107478. - D

Production scientifique protéomique

Ribeiro M, Costa J, Mafra I, Cabo S, Silva AP,Gonçalves B, Hillion M, Hébraud M, and Igrejas G. 2020. Natural variation of hazelnut allergenicity: is there any potential for selecting hypoallergenic varieties? Nutrients, 12(7):2100.

Bonnet M, Kaspric N, Vonnahme K, Viala D, Chambon C, and Picard B. 2020. Prediction of the secretome and the Surfaceome: a strategy to decipher the crosstalk between adipose and muscle during fetal growth. Int. J. Mol. Sci., 21(12):4375.

Bechaux J, Ferraro V, Sayd TChambon C, Le Page JF, Drillet Y, Gatellier P, and Santé-Lhoutellier V. 2020. Workflow towards the generation of bioactive hydrolysates from porcine products by combining in silico and in vitro approaches. Food Res. Int., 132:109123.

Douadi C, Vazeille E, Chambon C, Hébraud M, Dodel M, Pereira B, Coban A, Buisson A, and Barnish N. 2020. Quantitative proteomic analysis of macrophages from Crohn’s disease patients and infected with adherent-invasive Escherichia coli: impact of anti-TNF treatment. Gastroenterology, 158 (Issue 6 suppl. 1):S798.

Sabença C, Sousa T, Oliveira S, Viala D, Théron L, Chambon C, Hébraud M, Beyrouthy R, Bonnet R, Caniça M, Poeta P, and Igrejas G. 2020. Next-Generation Sequencing and MALDI Mass Spectrometry in the Study of Multiresistant Processed Meat Vancomycin-Resistant Enterococci (VRE). Biology, 9:89.

Bechaux J, Ferraro V, Sayd T, Chambon C, Le Page JF, Drillet Y, Gatellier P, and Santé-Lhoutellier V. 2020. Worflow towards the generation of bioactive hydrolysates from porcine products by combining in silico and in vitro approaches. Food Res. Int., 132:109123.

Sousa T, Viala D, Théron L, Chambon C, Hébraud M, Poeta P, and Igrejas G. 2020. Putative protein biomarkers of Escherichia coli antibiotic multiresistance identified by MALDI mass spectrometry. Biology, 9:56.

Boudon S, Ounaissi D, Viala D, Monteils V, Picard B, and Cassar-Malek I. 2020. Label free shotgun proteomics for the identification of protein biomarkers for beef tenderness in muscle and plasma of heifers. J. Proteomics, 217:103685.

Douadi C, Vazeille E, Chambon C, Hébraud M, Dodel M, Pereira B, Ccoban A, Buisson A, and Barnish N. 2020. Quantitative proteomic analysis of macrophages from Crohn’s disease patients and infected with adherent-invasive Escherichia coli. J. Crohn’s Colitis, 14 (Issue suppl. 1):S87-S88.

Théron L, Sayd T, Chambon C, Vautier A, Ferreira C, Aubry L, Venien A, Viala D, Astruc T, Ferraro V, and Sante-Lhoutellier V. 2020. Toward the Prediction of the PSE-Like Muscle Defect in Cooked Hams. Meat and Muscle Biology 4(2):13.  - D

2019

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Borgsmüller N, Gloaguen Y, Opialla T, Blanc E, Sicard E, Royer AL, Le Bizec B, Durand S, Migné C, Pétéra M, Pujos-Guillot E, Giacomoni F, Guitton Y, Beule D, Kirwan J. WiPP: Workflow for Improved Peak Picking for Gas Chromatography-Mass Spectrometry (GC-MS) Data. Metabolites. 2019 Aug 21;9(9). pii: E171. doi: 10.3390/metabo9090171. - D

Vázquez-Manjarrez N, Weinert CH, Ulaszewska MM, Mack CI, Micheau P, Pétéra M, Durand S, Pujos-Guillot E, Egert B, Mattivi F, Bub A, Dragsted LO, Kulling SE, Manach C. Discovery and Validation of Banana Intake Biomarkers Using Untargeted Metabolomics in Human Intervention and Cross-sectional Studies. J Nutr. 2019 Oct 1;149(10):1701-1713. doi: 10.1093/jn/nxz125. - C

Low DY, Lefèvre-Arbogast S, González-Domínguez R, Urpi-Sarda M, Micheau P, Petera M, Centeno D, Durand S, Pujos-Guillot E, Korosi A, Lucassen PJ, Aigner L, Proust-Lima C, Hejblum BP, Helmer C, Andres-Lacueva C, Thuret S, Samieri C, Manach C. Diet-Related Metabolites Associated with Cognitive Decline Revealed by Untargeted Metabolomics in a Prospective Cohort. Mol Nutr Food Res. 2019 Sep;63(18):e1900177. doi: 10.1002/mnfr.201900177. Epub 2019 Jul 9. - C

Lécuyer L, Dalle C, Lyan B, Demidem A, Rossary A, Vasson MP, Petera M, Lagree M, Ferreira T, Centeno D, Galan P, Hercberg S, Deschasaux M, Partula V, Srour B, Latino-Martel P, Kesse-Guyot E, Druesne-Pecollo N, Durand S, Pujos-Guillot E, Touvier M. Plasma Metabolomic Signatures Associated with Long-term Breast Cancer Risk in the SU.VI.MAX Prospective Cohort. Cancer Epidemiol Biomarkers Prev. 2019 Aug;28(8):1300-1307. doi: 10.1158/1055-9965.EPI-19-0154. Epub 2019 Jun 4. - C

Damont A, Olivier MF, Warnet A, Lyan B, Pujos-Guillot E, Jamin EL, Debrauwer L, Bernillon S, Junot C, Tabet JC, Fenaille F. Proposal for a chemically consistent way to annotate ions arising from the analysis of reference compounds under ESI conditions: A prerequisite to proper mass spectral database constitution in metabolomics. J Mass Spectrom. 2019 Jun;54(6):567-582. doi: 10.1002/jms.4372. - D

Ulaszewska MM, Weinert CH, Trimigno A, Portmann R, Andres Lacueva C, Badertscher R, Brennan L, Brunius C, Bub A, Capozzi F, Cialie Rosso M, Cordero CE, Daniel H, Durand S, Egert B, Ferrario PG, Feskens EJM, Franceschi P, Garcia-Aloy M, Giacomoni F, Giesbertz P, Gonzalez-Dominguez R, Hanhineva K, Hemeryck LY, Kopka J, Kulling SE, Llorach R, Manach C, Mattivi F, Migné C, Munger LH, Ott B, Picone G, Pimentel G, Pujos-Guillot E, Riccadonna S, Rist MJ, Rombouts C, Rubert J, Skurk T, Sri Harsha PSC, Van Meulebroek L, Vanhaecke L, Vazquez-Fresno R, Wishart D and Vergeres G (2019). Nutrimetabolomics: An Integrative Action for Metabolomic Analyses in Human Nutritional Studies. Molecular Nutrition & Food Research. 63. - C

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Lécuyer L, Dalle C, Lyan B, Demidem A, Rossary A, Vasson M-P, Petera M, Lagree M, Ferreira T, Centeno D, Galan P, Hercberg S, Deschasaux M, Partula V, Srour B, Latino-Martel P, Kesse-Guyot E, Druesne-Pecollo N, Durand S, Pujos-Guillot E, and Touvier M (2019). Plasma metabolomic signatures associated with long-term breast cancer risk in the SU.VI.MAX prospective cohort. Cancer Epidemiology, Biomarkers & Prevention. - C

Dao MC, Sokolovska N, Brazeilles R, Affeldt S, Pelloux V, Prifti E, Chilloux J, Verger EO, Kayser BD, Aron-Wisnewsky J, Ichou F, Pujos-Guillot E, Hoyles L, Juste C, Dore J, Dumas ME, Rizkalla SW, Holmes BA, Zucker JD, Clement K (2019). A Data Integration Multi-Omics Approach to Study Calorie Restriction-Induced Changes in Insulin Sensitivity. Frontiers in Physiology. 9. 1958. - S

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2018

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Comte B, Monnerie S; Brandolini-Bunlon M, Canlet C, Castelli F, Chu-Van E, Colsh B, Fenaille F, Joly C, Jourdan F, Lenuzza N, Lyan B, Martin J-F, Migné C, Morais J.A, Pétéra M, Poupin N, Vinson F, Thévenot E, Junot C, Gaudreau P, Pujos-Guillot E. Multiplatform metabolomics for an integrative exploration of metabolic syndrome.  submitted to EBIoMedicine